В недалеком будущем, когда остатки человечества покинули разрушенную Темными Ангелами Землю, жизнь на планете Вега протекает в спокойном, почти патриархальном ритме. Прошло 12 тысяч лет с событий первого сезона, и кажется, что прогресс отошел на второй план, убаюкивая обитателей планеты в уютное ощущение знакомства с XX веком. Однако эту идиллию нарушает вторжение с планеты Алтея, откуда прибывают гигантские машины-Сборщики, похищающие самых привлекательных и здоровых веганок. На защиту своего мира встают защитники Веги, полагаясь на старые боевые машины-Векторы, которые обладают силой противостоять обычным Сборщикам. Но даже они бессильны против хитроумных воинов-алтейцев, подкрепляющих атаки своих механизмов. В этом хаосе оказываются сирота Амата Сора и аристократка Миконо Судзусиро, которые только что встретились в старом кинотеатре. Во время сражения, когда их жизни были под угрозой, Амата, преодолев свои страхи, пробуждает силу Полета, которой он владел с самого детства. В результате из пыли и дыма битвы появляется могущественный Акварион. Теперь этот вчерашний сирота вступает в ряды организации Нео-ДИВА, становясь частью дружной семьи «элементов», и на Вегу вновь приходит надежда. Но с каждым новым днем появляются все более серьезные вопросы: почему обретение Аквариона на Алтее встречается с радостью? Какова истинная природа Аматы и кто он на самом деле? Является ли конфликт между двумя мирами разрешимым, или же у каждой из сторон есть свои причины и правда? С каждым поворотом сюжета открываются новые грани древних мифов, и ответ на эти вопросы откроет новые горизонты событий, в которых борьба за выживание и самоидентификацию будет продолжаться. В этом вихре конфликтов, надежды и тайн проложен путь к новому пониманию взаимосвязей между мирами, где зарождается настоящая драма и героизм.